بازی پیرامون شخصیتی با نام الکس میسون دنبال می‌شود. او یکی از اعضای سازمان CIA است. در سال 1968، میسون به یک صندلی در اتاقی مخفی بسته شده و مورد بازجوئی توسط گروهی از گروگان‌گیرها قرار می‌گیرد. آنان از او سوالاتی پیرامون پایگاه اعداد می‌پرسند ، الکس میسون به عنوان تلاش برای پاسخ به سوالات، چندین رویداد را نام می‌برد. در سال 1961، Mason, Woods و Bowman در عملیات 40 جهت ترور کردن فیدل کاسترو در کوبا و در مکانی موسوم به خلیج خوک‌ها شرکت داشته‌اند. الکس میسون در ادامه موفقیت ترور فیدل کاسترو، برای فرار از خاک کوبا نیاز به یک هواپیما پیدا می‌کند. اما به دلیل افزایش نیروهای امنیتی برای کشتار آنان، میسون تصمیم به حمایت از دوستان خود گرفته و به نیروهای کوبایی حمله می‌کند، اما در نهایت او موفق به مقابله با تعداد بالای این نیروها نشده و آنان او را دستگیر می‌کنند. پس از آنکه میسون به زندان منتقل می‌شود، او در آنجا با یک فرد روسی با نام ویکتور رزناف آشنا می‌شود. در سال‌های زندانی بودن، میسون و رزناف، نقشه‌ای برای فرار از زندان ورکوتا طرح‌ریزی کرده و به شکلی زیبایی نیز آن را اجرا می‌کنند؛ اما در نهایت این تنها میسون است که می‌تواند به سلامت از محوطه خارج شود. با بازگشت الکس میسون به ایالات متحده آمریکا، جان اِف کندی رئیس جمهور سابق آمریکا، مأموریت مهمی را به او محول می‌کند. او به میسون می‌گوید برای حفظ جهان از خطرات، لازم است Dragovich را که یک فرد روسی الاصل است را از بین ببرد. الکس میسون که نیز منتظر فرصتی این چنینی است، برای انتقام خود را آماده می‌کند.